Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD1Q15797 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD1Q15797 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD1Q15797 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD1Q15797 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD1Q15797 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD1Q15797 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD1Q15797 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD1Q15797 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD1Q15797 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD1Q15797 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD1Q15797 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD1Q15797 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD1Q15797 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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