Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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EFNB3Q15768 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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EFNB3Q15768 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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EFNB3Q15768 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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EFNB3Q15768 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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EFNB3Q15768 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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EFNB3Q15768 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFNB3Q15768 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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