Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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SEC23BQ15437 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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SEC23BQ15437 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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SEC23BQ15437 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23BQ15437 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23BQ15437 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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