Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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