Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPNMBQ14956 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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