Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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SEMA3AQ14563 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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SEMA3AQ14563 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3AQ14563 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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