Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCN5AQ14524 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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