Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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SCARB2Q14108 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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SCARB2Q14108 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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SCARB2Q14108 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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SCARB2Q14108 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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SCARB2Q14108 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARB2Q14108 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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