Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
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PDE6HQ13956 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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PDE6HQ13956 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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PDE6HQ13956 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
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PDE6HQ13956 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
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PDE6HQ13956 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
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PDE6HQ13956 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
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PDE6HQ13956 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
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PDE6HQ13956 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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PDE6HQ13956 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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PDE6HQ13956 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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