Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
APOFQ13790 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
APOFQ13790 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms