Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
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