Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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