Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CBX3Q13185 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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