Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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