Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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GRIK3Q13003 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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