Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
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CHD3Q12873 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CHD3Q12873 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHD3Q12873 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHD3Q12873 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHD3Q12873 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHD3Q12873 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHD3Q12873 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHD3Q12873 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CHD3Q12873 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
CHD3Q12873 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CHD3Q12873 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHD3Q12873 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CHD3Q12873 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHD3Q12873 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CHD3Q12873 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHD3Q12873 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CHD3Q12873 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CHD3Q12873 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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