Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms