Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
CENPEQ02224 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms