Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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PGGT1BP53609 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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PGGT1BP53609 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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PGGT1BP53609 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
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PGGT1BP53609 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
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PGGT1BP53609 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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