Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CENPFP49454 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CENPFP49454 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CENPFP49454 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CENPFP49454 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CENPFP49454 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CENPFP49454 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CENPFP49454 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CENPFP49454 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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CENPFP49454 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
CENPFP49454 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
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CENPFP49454 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
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CENPFP49454 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CENPFP49454 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
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CENPFP49454 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
CENPFP49454 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CENPFP49454 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CENPFP49454 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CENPFP49454 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CENPFP49454 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CENPFP49454 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
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CENPFP49454 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CENPFP49454 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CENPFP49454 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CENPFP49454 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CENPFP49454 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CENPFP49454 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CENPFP49454 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CENPFP49454 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CENPFP49454 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CENPFP49454 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
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CENPFP49454 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CENPFP49454 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
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CENPFP49454 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPFP49454 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPFP49454 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPFP49454 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
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CENPFP49454 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPFP49454 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPFP49454 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPFP49454 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPFP49454 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPFP49454 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
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