Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP9BO43861 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP9BO43861 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms