Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TMOD3Q9NYL9 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms