Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
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USP53Q70EK8 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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USP53Q70EK8 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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USP53Q70EK8 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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USP53Q70EK8 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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USP53Q70EK8 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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USP53Q70EK8 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
USP53Q70EK8 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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