Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
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FOXD1Q16676 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC8.55□□□□□ -1.04
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FOXD1Q16676 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
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FOXD1Q16676 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
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FOXD1Q16676 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
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FOXD1Q16676 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
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FOXD1Q16676 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
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FOXD1Q16676 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
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FOXD1Q16676 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
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FOXD1Q16676 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
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