Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FSCN1Q16658 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.1 ms