Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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