Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms