Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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