Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KARSQ15046 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KARSQ15046 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KARSQ15046 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KARSQ15046 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KARSQ15046 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KARSQ15046 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KARSQ15046 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KARSQ15046 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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