Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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COL19A1Q14993 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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