Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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