Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL9A3Q14050 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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