Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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GTF2H2Q13888 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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GTF2H2Q13888 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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GTF2H2Q13888 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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GTF2H2Q13888 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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GTF2H2Q13888 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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GTF2H2Q13888 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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GTF2H2Q13888 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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