Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL3Q13618 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL3Q13618 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL3Q13618 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL3Q13618 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL3Q13618 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL3Q13618 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL3Q13618 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL3Q13618 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL3Q13618 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL3Q13618 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL3Q13618 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL3Q13618 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL3Q13618 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL3Q13618 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL3Q13618 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL3Q13618 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL3Q13618 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CUL3Q13618 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms