Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
TCOF1Q13428 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms