Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDE3BQ13370 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms