Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATMQ13315 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATMQ13315 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATMQ13315 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATMQ13315 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATMQ13315 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ATMQ13315 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATMQ13315 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ATMQ13315 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATMQ13315 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ATMQ13315 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ATMQ13315 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ATMQ13315 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC-0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC-0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC-0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC-0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
ATMQ13315 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATMQ13315 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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