Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GPS1Q13098 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms