Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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