Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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GTF3C1Q12789 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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GTF3C1Q12789 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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GTF3C1Q12789 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
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GTF3C1Q12789 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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GTF3C1Q12789 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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GTF3C1Q12789 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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