Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NUP160Q12769 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NUP160Q12769 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms