Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHRNEQ04844 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165 ms