Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CENPEQ02224 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPEQ02224 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms