Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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