Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERVV-1B6SEH8 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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ERVV-1B6SEH8 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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ERVV-1B6SEH8 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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