Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NRXN1Q9ULB1 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NRXN1Q9ULB1 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
NRXN1Q9ULB1 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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NRXN1Q9ULB1 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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NRXN1Q9ULB1 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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NRXN1Q9ULB1 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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NRXN1Q9ULB1 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NRXN1Q9ULB1 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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