Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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SH3BP4Q9P0V3 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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SH3BP4Q9P0V3 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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SH3BP4Q9P0V3 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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SH3BP4Q9P0V3 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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SH3BP4Q9P0V3 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP4Q9P0V3 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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