Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KCNS3Q9BQ31 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
KCNS3Q9BQ31 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms