Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CAPNS2Q96L46 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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