Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

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Length 813 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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SNX29Q8TEQ0 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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SNX29Q8TEQ0 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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SNX29Q8TEQ0 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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SNX29Q8TEQ0 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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SNX29Q8TEQ0 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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SNX29Q8TEQ0 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SNX29Q8TEQ0 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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